Накопители с Advanced Format также лучше сохраняют целостность данных, поскольку в них применяется более эффективная система исправления ошибок с более длинными кодовыми словами ECC. Размер сектора в 512 байт был стандартом на протяжении более 30 лет. В результате этого многие компоненты вычислительных систем (таких как персональные компьютеры, серверы, DVR, PSP и мобильные телефоны) стали неспособны работать ни с какими другими секторами, кроме 512-байтовых. Для обеспечения совместимости с этими устройствами в изделиях с технологией Advanced Format используется эмуляция 512-байтовых секторов.

Технология Advanced Format предназначена для работы с большинством современных операционных систем, таких как Windows Vista, Windows 7 и Mac OS X. При этом производитель отмечает, что как и многие другие новые технологии, Advanced Format неоптимально работает с "устаревшими" операционными системами, как Windows XP. Тем, кто все еще пользуется Windows XP, компания WD предлагает простую программу WD Align, применение которой обеспечивает полноценную скорость работы накопителей с технологией Advanced Format под управлением этой ОС.